广西水产畜牧学校的前身是广西水产学校，成立于1960年，由原广西农业厅覃宝龙副厅长兼首任校长，当年招生208人。1962年7月，根据全区教育行政会议决定，停止办学，校园暂划给原广西水产研究所，作为生产、科研使用。1978年经自治区人民政府批准学校恢复办学。2003年更名为广西水产畜牧学校。

学校恢复办初期至1990年，只设置淡水养殖一个专业，1991年增设海水养殖专业，1993年增设渔业经济管理专业，1994年增设特种水产品养殖专业和渔政管理专业，1996年增设水产品贸易专业和水产品加工专业，1997年增设轮机专业，1998年增设多种经营专业。2002年增设畜牧兽医专业。随着国家对中职学校开设专业的政策进一步放宽，学校还先后增设了一些非涉农类专业，后来部分专业撤并，部分专业停招。学校目前共开设21个专业、1个专业方向，覆盖农林牧渔、装备制造、交通运输、电子与信息、财经商贸、旅游、文化艺术、教育与体育等多个专业大类，形成了“以农为本、工科增强、商贸服务配套、体育特色新增”的多元化专业结构。根据专业属性与内在关联，学校将现有专业划分为4大类别进行统筹管理：动科类专业立足学校传统根基，涵盖淡水养殖、畜禽生产核心领域；机电类专业对接先进制造业与现代装备应用，服务于交通、冷链、信息技术等领域；工商类专业覆盖现代服务业，聚焦烹饪加工、商贸流通、生活服务、财会管理等领域；体育类专业响应健康中国战略，培养体育产业技能人才。

历经几代人的努力，学校办学规模不断扩大，办学层次呈现多样化，已形成以中等职业教育为主，以成人教育、高职教育（合作办学）、渔业和家畜家禽饲养行业特有工种职业技能鉴定等为辅的良好局面。学校于2000年设立上海海洋大学（原上海水产大学）广西函授站、2000年设立广西渔业行业特有工种职业技能鉴定站（2008年增加家畜饲养工和家禽饲养工职业技能鉴定）、2003年设立南京农业大学南宁函授站。2005年至今与广西职业技术学院合作开办畜牧兽医专业高职教育。

自办学以来，学校坚持党的教育方针，坚持“以育人为本、以就业为导向”的办学理念，励精图治、开拓创新，教育教学质量居全区先进水平，已累计为广西及周边地区培养了5万余名毕业生，并获得多项荣誉，是自治区级重点中等职业学校、自治区级示范性中等职业学校、自治区级示范特色中等职业学校、自治区四星级中等职业学校、广西优质中职学校、广西绿色学校、广西三全育人典型学校、全国青少年校园足球特色学校、自治区文明单位、自治区文明校园、自治区卫生优秀学校、花园式单位、综合治理模范单位。目前，学校学校拥有专任教师204人，其中，正高级教师8人，占比3.92%；副高级教师34人，占比16.67%；中级教师62人，占比30.39%；初级教师38人，占比18.63%。35-50 岁中青年教师成为主力军，队伍梯队更趋合理。另外学校还长期聘请一批在生产、科研第一线的专家学者作为客座教授或办学顾问。在校生规模达5500多人。

雄关漫道真如铁，而今迈步从头越。展望未来，任重道远，今天的广西水产畜牧学校面临前所未有的历史机遇，学校领导班子正率领学校全体干部和教职员工，秉承“执教为民”的信念，不断挖掘潜力，创造条件，全面推进特色教育，以高质量的教育教学成绩回报学生、家长和社会，以饱满的激情向更高的办学层次迈进！